本院創立於1986年元旦，歷經30年成長，從專業走向卓越，目前開放病床2,691床，員工6,000餘人，每日平均門診服務量7,600餘人次，急診371餘人次，是衛福部評定之特優醫學中心，有81個專科及次專科，肩負服務、教學與研究的任務，本院落實以病人為中心、員工為本的醫療，強調科際整合，並建構人性化且安全之環境，維護病人權益，透過共識及管理，創新醫療技術，提供優質員工生活環境，提升照護品質。
在研究領域方面，研究區域佔地4,000坪以上，除了設立人體生物資料庫外，亦設立1個研究所(生物醫學轉譯研究所)、2個科研究中心(震波醫學與組織再造科研究中心及粒線體醫學科研究中心)、9個核心實驗室/研究平台(基因暨蛋白質體核心實驗室、幹細胞研究核心實驗室、實驗動物型態鑑定暨診斷核心實驗室、組織銀行核心實驗室、生物統計核心實驗室、實驗動物中心、臨床試驗中心、細菌病毒庫、無菌生物醫學核心實驗室)以及14間具研究主題特色之實驗室，以提供完善的研究環境；卓越研究成果包括免疫與再生及心臟血管醫學、肝臟移植、神經科學、震波醫學、更年期暨生殖醫學、粒線體等，持續積極擴展研究領域，落實臨床應用，開創研究新契機。
高雄長庚紀念醫院人體生物資料庫係依據衛生福利部「人體生物資料庫管理條例」設置成立，目的為提供本院醫學研究穩定可靠的生物檢體來源及系統性的臨床資料，儲存生物檢體類型主要為冷凍組織檢體及血液檢體，至2020年已達9,756例收案數，多數疾病類型以腫瘤相關疾病為主，其中肝臟類型的檢體最多，其次為大腸直腸檢體。此外在長庚體系政策下，單位之核心實驗室建構多項研究設備，包含自動化核酸萃取、玻片掃描儀、雷射顯微切割系統等儀器，以供相關醫學研究使用，進而促進本院生物醫學發展。
此外在加入「國家級人體生物資料庫整合平台」後，單位於2019年增加組織檢體確認作業，並在合法取得受試者同意的情形下，提供整合平台申請者編碼化檢體及臨床資訊，藉由加入整合平台優化的整體檢體品質並服務更廣泛的研究人員，希望未來研究成果能增進人民健康福祉。