本院人體生物資料庫，初期以台灣十大癌症為收案目標，並以新鮮液態氮組織檢體為優先。之後陸續拓展檢體類別多元性，加入產科子癲癇症病人血液和組織檢體及皮膚癌、軟組織瘤、甲狀腺癌、腦下垂體腺瘤、腦瘤、腦膜瘤等冷凍組織檢體；近年更將術後蠟塊檢體的收集與使用納入新版病人知情同意書中，大幅增加研究用蠟塊檢體數量以供研究之需。入庫的檢體均有定期抽樣品管，以確保未來能提供研究者高品質的檢體。研究者可申請的檢體種類包括血漿、血清、石蠟切片、DNA、RNA等等，庫存檢體的種類及數量定期更新於國家級人體生物資料庫整合平台，客製化的檢體需求也能聯絡本庫得到詳細的諮詢。
關於檢體及臨床資料的收集與運用，本庫設有倫理委員會以審查申請案中有關參與者保護和資安管理是否合宜，亦另設監理委員會以管理與審查本庫檢體與資料之收案和申請運用情況。經由定期召開的核心實驗室會議、倫理委員會議和監理委員會議，落實本庫檢體、資料管理及使用之制度化。
