為因應「人體生物資料庫設置管理條例」之公布施行，本院於2012年籌備成立人體生物資料庫，並於2013年7月16日經衛生福利部核准設立。目前收存之檢體包含：配對之腫瘤及正常組織、血清、血漿、血球、初代培養細胞株、蠟塊及玻片等，含括32大類疾病及健康人檢體。現況檢體皆無償開放院內研究人員申請運用，院外機構亦可透過與本院醫師研究合作或國家級人體生物資料庫整合平台轉介提出申請。
除檢體申請服務外，本資料庫亦提供包含核酸萃取(DNA/RNA purification)、組織微陣列製作(Tissue microarray construction)、雷射顯微擷取(Laser capture microdissection)以及免疫組織化學染色(Immunohistochemical staining)等四項核心服務。為控管服務品質，本庫收檢流程及核心服務已於2011年通過ISO17025認證，此外固定每季抽驗檢體DNA及RNA並持續改進收檢流程以提供研究人員高品質之檢體。
本資料庫任務除提升本院之研究競爭力外，亦積極配合國家政策，於2020年1月加入「國家級人體生物資料庫整合平台」，提供國內醫藥生技研究與精準醫療發展之重要檢體及資料來源。截至2021年2月28日為止，已採集並上傳4836人次之檢體資料至平台，希望藉此資源共享，加速國內生醫研究、精準藥物以及人工智慧醫療的發展，提升全民健康福祉。